Edward Elric
Vestito con l'uniforme militare, Edward è stato promosso a colonnello e la mattina il suo compito consiste nel portare il thè al Fuhrer ed al Generale Roy Mustang. Tutto pare svolgersi tranquillamente, nonostante le prese in giro di Roy Edward riesce finalmente a vivere tranquillo. Fino a quando un giorno Edward si rende conto di essere stato giocato per quanto riguarda il corpo di Ed. Il prezzo pagato non è stato infatti abbastanza. Ed si rimprometterà quindi di fare tutto ciò che è in suo potere per salvare in fratello, senza importarsi di quali possano essere le conseguenze.
Alphonse Elric
Ora Alphonse ha una vita tranquilla, sta sempre a casa e si occupa delle faccende domestiche. Cucinare, pulire, è sempre lo stesso e prova ancora un grandissimo affetto nei confronti del fratello maggiore. Segretamente, si domanda per quale motivo gli arti di Ed non siano tornati normali, e tenta di fare delle ricerche a riguardo mentre Ed dorme. Più avanti però Alphonse ha una strana sensazione di rigetto da parte del suo corpo.
Roy Mustang
Ora Generale, Roy ora si sente sempre più vicino al suo obiettivo. Non perde occasione per prendere in giro Ed, come suo solito. Ma nell'esercito ci sono ancora cose a lui sconosciute, e quando Ed scompare misteriosamente Roy comincia ad insospettirsi. Roy deciderà quindi di cercarlo, aiutando in questo modo anche Alphonse.
Riza Hawckeye
Decisa e risoluta come al solito, la sua lealtà nei confronti di Roy si dimostra fondamentale, dimostrandosi letale per chi cerca di attentare alla vita del Generale. Vorrebbe aiutare Alphonse e Roy durante la ricerca di Edward, essendosi anche nel corso del tempo affezzionata ai fratelli Elric, ma i due non la avvertono dei loro spostamenti.
King Bradley
King in questo gioco è invece il manipolativo homunculus Wrath. Insinuatosi in accademia, anche qui ne è il Fuhrer, e supervisiona e dirige le operazioni segrete e corrotte necessarie per raggiungere i loro scopi e proseguire il compirto degli homunculus, in modo tale da riuscire a realizzare il loro progetto segreto. La fiducia nei suoi confronti da parte di Ed e Roy si dimostrerà spesso favorevole.
Pride
Il risultato della resurrezione di Edward in uno dei finali, molto simile ad Envy ed agli altri homunculus, Pride non ricorda nulla della sua vita precedente. Molto silenzioso, questo personaggio apparentemente privo di espressione potrebbe dimostrarsi sadico e crudele quanto Envy, se non di più.
Da
FMA Planet'K-Kono.. baka inu!!'
Chanto koko ni ite! watashi no chikaku de
zutto watashi wo itsumo itsumo mitsumete nasai
yosomi shiteta desho hoka no onna no ko
oshiyo kisuruwa furari furari furachi na yatsu wa
Don't touch! kikanai kara ne iiwake wa
Touch me... tsukareta kara... nee kata wo kashite yo
(*)suki yo nante uso yo
kirai sore mo uso da wa
nai nai nai dame yo kanjinai
dakara [suki yo] nante iwanai
Non Non Non dokka he ittara
zettai ni yurusanai kara ne!
Datte
honto wa dare yori soba ni itai no
Ai no futari de saiboshimasho!
'Honto wa, honto wa suki... kana?'